Ya sabréis lo importante que es tenerlos los servidores sincronizados, yo siempre lo hago tras instalar debian.
Esto es solo una receta rápida, si queréis profundizar en el tema, os remito a un exclente artículo de Guillermo Ballester, así como a la propia documentación de ntp, que es el protocolo que utilizaremos para sincronizarnos.

Instalación:

apt-get install ntp

Configuración:

Lo primero es averiguar contra que servidores de tiempo vamos a sincronizarnos. Podemos hacer uso del proyecto pool.ntp.org para averiguar que servidores podemos utlizar. Es recomendable utilizar alguno cercano a tu red, para evitar latencias. En la web de pool.ntp.org, podéis ver que servidores están disponibles para vuestra zona, por ejemplo aquí tenéis la de España.
Una vez averiguados, los cambiamos por los que vienen por defecto en debian (también del proyecto pool.ntp.org):

vim /etc/ntp.conf

Buscamos:

server 0.debian.pool.ntp.org iburst
server 1.debian.pool.ntp.org iburst
server 2.debian.pool.ntp.org iburst
server 3.debian.pool.ntp.org iburst

Y lo sustituimos por los nuestros (en caso de España):

server 3.es.pool.ntp.org iburst
server 0.europe.pool.ntp.org iburst
server 2.europe.pool.ntp.org iburst

Ya está casi terminada, solo quedá determinar en que zona horaria queremos que esté nuestro servidor (para España peninsula):

rm /etc/localtime && ln -s /usr/share/zoneinfo/Europe/Madrid /etc/localtime && /etc/init.d/ntp restart

Si queréis otra zona, enlazáis otro fichero correspondiente a la vuestra.

Al cabo de un rato podéis ver que servidores ha tomado y sus preferencias.

ntpq -pn

remote refid st t when poll reach delay offset jitter
==============================================================================
-92.243.3.208 5.50.231.53 3 u 58 64 377 0.312 8.173 5.636
+88.191.23.205 88.191.254.7 3 u 53 64 377 1.367 -15.550 7.650
+88.191.19.23 195.220.94.163 2 u 57 64 377 1.381 -70.797 7.425
*212.85.158.10 195.220.94.163 2 u 45 64 377 12.489 -7.846 13.375